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23/10/2018

Edital para Exame de Seleção - Pós-Doutorado PNPD/CAPES



19/04/2018 - Curso Posgrado

Estrategias y herramientas moleculares para el estudio de variantes genéticas en microbiología. Lugar: Instituto de Virología “Dr. J. M. Vanella”- FCM- UNC. Dirección: Enfermera Gordillo Gomez s/n- Ciudad Universitaria – CP: 5016 Universidad Nacional de Córdoba, Córdoba Argentina. Fecha: 25 al 29 de JUNIO de 2018 Horario: 9:00 a 17:00 hs. Duración: 40 horas (25 hs teóricas 15 hs prácticas) DIRECTORES: Dra. Viviana Ré, Dra. Dra. María Belén Pisano COORDINADOR: Dra. Gisela Masachessi CONTACTO: vivianare@fcm.unc.edu.ar, mbelenpisano@gmail.com, gmasachessi@fcm.unc.edu.ar DOCENTES /Institución TEMA Dra. Sandra Gallego – InViV-Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de Córdoba, Argentina. Introducción a la biología molecular Dra. Viviana Ré – InViV- Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de Córdoba, Argentina. Conceptos básicos de amplificación de ácidos nucleicos, y su aplicación en la caracterización genética en microbiología Optimización de técnica de PCR Dra. M. Belén Pisano InViV-Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de Córdoba, Argentina. Conceptos básicos de la secuenciación tradicional. Introducción a Bioinformática. Dr. Adrián Díaz – InViV - Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de Córdoba, Argentina. Introducción a Bioinformática. TP Dra. Gisela Massachessi. InViV - Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de Córdoba, Argentina. Introducción a Bioinformática. TP Dr. Guillermo Albrieu. InViV-Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de Córdoba, Argentina. Estructura genética poblacional de virus y su asociación con eventos de dispersión biológica Dr. Adrián Farias. InViV - Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de Córdoba, Argentina. PCR tiempo real. TP Dra. Laura Tauro –Inst. Nacional de Medician Tropical , Puerto Iguazu. Misiones Secuenciación de Nueva Generación (NGS) Aplicación de la metodología NGS al estudio de microorganismos. Laura L. Otero, PhD Thermo Fisher ScientiField Application Scientistfic Técnicas moleculares. PCR en tiempo real y PCR digital Mag. Gonzalo Rodríguez – Lab. Hemoderivados, Universidad Nacional de Córdoba, Argentina. Aplicación de CI en el control de calidad de productos Hemoderivados Introducción El proceso evolutivo involucra a todas las organizaciones vivientes, de las cuales no se excluyen las bacterias y los virus, particularmente los virus con genoma RNA. La aparición de variantes virales, es un mecanismo evolutivo empleado por los virus para perpetuarse en la naturaleza, que trae como consecuencia la disminución o aumento de su potencial lítico o la evasión a la respuesta inmune del huésped. Las variaciones genéticas y fenotípicas de los microorganismos también pueden afectar su capacidad patógena, de transmisión, su eficiencia de infección, la respuesta a los tratamientos y a la protección de las vacunas disponibles, como así también, tener implicancias en la sensibilidad y especificidad de las pruebas para diagnóstico que se usan actualmente. Las estrategias y tecnologí as moleculares desarrolladas e implementadas en los laboratorios han tenido en los u ltimos an os repercusiones en todas las vertientes de la biomedicina: diagno stico, prono stico y terape utica. La reaccio n en cadena de la polimerasa, conocida como PCR por sus siglas en ingle s (Polymerase Chain Reaction), es una te cnica de biologí a molecular desarrollada en 1983 por Kary Mullis, cuyo objetivo es obtener un gran nu mero de copias de un fragmento de ADN particular a partir de una u nica copia de ese fragmento original, o molde. Su utilidad es que tras la amplificacio n resulta mucho ma s fa cil identificar con muy alta probabilidad, virus o bacterias causantes de una enfermedad, identificar personas (cada veres) o hacer investigacio n cientí fica sobre el ADN amplificado. Sin lugar a dudas esta te cnica constituyo el puntapie inicial de una nueva generacio n de herramientas de diagno stico aplicadas al estudio de ADN geno mico obtenido de diversas fuentes biolo gicas y para diferentes fines. Estas te cnicas, marcaron un cambio en el protagonismo del diagno stico microbiolo gico, pasando de estar relegado a una estrecha franja de la pra ctica me dica a constituir un elemento fundamental en el abordaje de las enfermedades infecciosas no so lo en medicina sino tambie n en veterinaria, agronomí a, odontologí a, entre otros. La bioinforma tica (aplicacio n de tecnologí a computacional a la gestio n y ana lisis de datos biolo gicos) fue una incorporacio n fundamental para el mejoramiento y sistematizacio n de los ana lisis. Los te rminos bioinforma tica, biologí a computacional y, en ocasiones, biocomputacio n, utilizados en muchas situaciones como sino nimos, hacen referencia a campos de estudios interdisciplinarios muy vinculados, que requieren el uso o el desarrollo de diferentes te cnicas que incluyen informa tica, matema tica aplicada, estadís tica, ciencias de la computacio n, inteligencia artificial, quí mica y bioquímica para solucionar problemas, analizar datos, o simular sistemas o mecanismos, todos ellos de í ndole biolo gica, y usualmente en el nivel molecular. El nu cleo principal de estas te cnicas se encuentra en la utilizacio n de recursos computacionales para solucionar o investigar problemas sobre escalas de tal magnitud que sobrepasan el discernimiento humano. Una constante en proyectos de bioinforma tica y biologí a computacional es el uso de herramientas matema ticas para extraer informacio n u til de datos producidos por te cnicas biolo gicas de alta productividad, como la secuenciacio n del genoma. La heterogeneidad gene tica de determinados microorganismos y la diversidad de las secuencias geno micas puede ser examinada mediante el ana lisis molecular (secuencia de nucleo tidos) y bioinforma tico (ana lisis filogene tico). A su vez es posible establecer sitios de mutaciones de resistencia a la terapia, sitios claves de ingreso o egreso del microorganismo a la ce lula hue sped, sitios para el disen o de herramientas diagno sticas (específicos, gene ricos, filogenia), sitios blanco altamente conservadas para inducir respuesta celular y humoral confiables para el disen o de vacunas, entre otros. Otra disciplina gene tica que ha permitido muchos avances es la gene tica inversa la que a partir del conocimiento de un fragmento de ADN clonado o secuenciado, investiga sobre su funcio n biolo gica alterando dicho ADN mediante mutacio n, generalmente a nivel masivo. Ma s recientemente las te cnicas de secuenciacio n de nueva generacio n (NGS new generation sequencing) han revolucionado las estrategias para el estudio del genoma, facilitando el estudio del mismo en menor tiempo. Conocer en profundidad esta metodología resulta indispensable para la planificacio n de nuevos estudios incorporando tecnologí a de avanzada. El curso presentado pretende brindar al participante conocimientos ba sicos de los aspectos relacionados al estudio de variantes gene ticas en microbiología, incorporando metodologías moleculares tradicionales y de avanzada. Así mismo, se espera promover la formacio n te cnico-acade mica de recursos humanos. Objetivos: Brindar conocimientos básicos de los aspectos relacionados al estudio de variantes genéticas en microbiología, incorporando metodologías moleculares tradicionales y de avanzada. - Aplicar los conocimientos aprendidos en la resolución de problemas diagnósticos, epidemiológicos y en la práctica científica. Programa Teórico – Práctico DIA 1 (25/6) Teóricos: • Introducción a la biología molecular. Fundamentos. Dra. Sandra Gallego Antecedentes históricos de la biología molecular. Estructura del ADN. Procesos de replicación y enzimas aplicadas. • Amplificación de ácidos nucleicos y caracterización genética. Reacción en cadena de la Polimerasa (PCR). Aplicación de PCR en detección de variantes genéticas. Dra. Viviana Elizabeth Ré, Métodos de extracción de ácidos nucleicos: ADN y ARN. Optimización de la PCR. Transcripción reversa (RT). Clasificación de las técnicas clásicas de biología molecular. PCR y sus variantes. Implementación y Optimización de la PCR. Variables a tener en cuenta. • Diseño de control Interno (RNA) para su aplicación en la validación de técnicas moleculares. Aplicación de un control interno en el control de calidad de productos Hemoderivados. Mg. Gonzalo Rodríguez. Teórico – Práctico: Procesamiento y extracción de ARN/ADN a partir de diferentes matrices. Aplicación de control interno. Dra. M. Belén Pisano, Mg. Gonzalo Rodríguez, Dra. Gisela Masachessi. DIA 2 (26/6) Conceptos Básicos de PCR en Tiempo Real (qPCR) y PCR digital. Laura L. Otero, PhD. ThermoFisher ScientiField. Trabajo Práctico: PCR -REAL TIME. Dra. Laura L. Otero, Dra. M. Belén Pisano, Dr. Adrián Farías. DIA 3 (27/6) Estructura genética poblacional de virus y su asociación con eventos de dispersión biológica. Dr. Guillermo Albrieu– Dr. Adrián Díaz - InViV, UNC Conceptos básicos de la secuenciación tradicional. 9 – 13 h. Dra. Belén Pisano Introducción a la Bioinformática. Su utilidad como herramienta científica. Diseño de primers y sondas para la implementación de herramientas diagnósticas. Supuestos y limitaciones. Obtención de muestras para la amplificación y secuenciación genómica. Obtención, envío y procesamiento de las muestras. Métodos de Concentración y purificación de ADN. Requerimientos especiales para la secuenciación. Obtención de la información genética. Bases de datos genéticas. Lectura y corrección de Cromatogramas. Fuente de datos para la realización de análisis bioinformáticos y filogenéticos. Bases de datos de secuencias: NCBI (GenBank), EMBL. Búsquedas de información en las bases de datos. Alineamiento de Secuencias. Alineamientos de secuencias de a pares. Formato FASTA. BLAST. Manejo de Programa BIOEDIT y MEGA. Métodos basados en distancias, máxima parsimonia, máxima verosimilitud. Confección y búsqueda del árbol óptimo. TRABAJO PRÁCTICO: Trabajo práctico con computadoras y programas bioinformáticos. Dra. Gisela Masachessi, Dra. Viviana Ré, Dra. M. Belén Pisano, Dr. Adrián Díaz Dr. Guillermo Albrieu. DIA 4 (28/6) PRÁCTICO Trabajo práctico con computadoras y programas bioinformáticos. Dra. Gisela Masachessi, Dra. Viviana Ré, Dra. M. Belén Pisano, Dr. Adrián Díaz Dr. Guillermo Albrieu. TEÓRICO • Secuenciación de Nueva Generación (NGS). Fundamentos de las metodologías, preparación de las muestras, utilidad como herramienta científica, beneficios y limitaciones. Aplicación de la metodología NGS al estudio de Arbovirus. Dra. Laura Tauro DIA 5 Evaluación escrita: Presentación de un proyecto basado en la aplicación de estrategias moleculares. Nota: Los alumnos podrán trabajar sobre la base de los modelos de sus respectivos proyectos o de lo contrario de algún modelo a elección. Evaluación oral: Discusión y presentación del proyecto propuesto. La evaluación será aprobada con nota mayor a 7 en una escala de 1 a 10. Bases El Curso tendrá lugar los días Lunes 25 a 29 de junio de 2018 de 9:00 a 17:00 hs. en el Instituto de Virología “Dr. J. M. Vanella” FCM-UNC. Enfermera Gordillo Gómez s/n Ciudad Universitaria. Cupo máximo Teórico: 30 participantes. Cupo práctico 15. Los interesados podrán realizar la preinscripción hasta el día 15 de junio y recibirán la comunicación de su aceptación aproximadamente el 18 de junio. Enviar la manifestación de interés junto a una descripción de los antecedentes del postulante o un CV no mayor de 3 páginas y las razones por las que desea hacer el curso a: mbelenpisano@gmail.com, vivianare@fcm.unc.edu.ar. El costo del curso es de $1550 más una inscripción de $ 450 que se abonará en la Secretaría de Posgrado de la Facultad de Cs. Médicas - UNC, el mismo día del inicio del curso.



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